• Напишите нам
  • mail@snablab.ru
  • +7 (499) 742-86-21
+7(495)660-35-58 +7(499)742-86-21 Перезвоните мне
с 10:00 до 18:00
0 Избранное
0 Сравнение
0 Корзина
Каталог товаров

Каталог

COVID-19

Описание

Коронавирусы – РНК (+) содержащие вирусы из семейства Coronaviridae – это большая группа вирусов, некоторые из которых вызывают болезни у людей (респираторные, диареи), многочисленные коронавирусы циркулируют среди животных, включая верблюдов, кошек и летучих мышей. В редких случаях коронавирусы животных могут претерпевать изменения и заражать людей, а затем распространяться между людьми, как это наблюдалось при коронавирусе респираторного синдрома Ближнего Востока (MERS-CoV) и коронавирусе тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV), а также коронавирусе 2019-nCoV (2019 – настоящее время).

В настоящее время известно, что вирус 2019-nCoV активно передаётся от человека к человеку (пути передачи: воздушно капельный – выделение вируса при кашле, чихании и разговоре, воздушно-пылевой, контактный и фекально-оральный), вызывая высокую смертность среди заразившихся индивидов. Тяжесть заболевания – непредсказуема. Специфического лечения или вакцины против коронавируса не существует, осуществляется поддерживающая терапия в условиях карантина пациента. Основные пути профилактики: защита органов дыхания, слизистых оболочек, гигиена.

Бессимптомный инкубационный период – до 14 суток (по некоторым данным до 21 суток). В среднем, в 16% случаев заболевание протекает бессимптомно [1], по другим данным – в 25% случаев на ранних этапах заболевания (впоследствии значение снижается до 8,4% случаев) [2]. Любые бессимптомные носители способны заражать окружающих [3], в их верхних дыхательных путях зафиксированы вирусные частицы в концентрациях, схожих с аналогичными показателями больных, проявляющих симптомы заболевания [4]. В инкубационный период концентрация вируса в верхних дыхательных путях меньше, чем в момент появления симптомов, что затрудняет диагностику заболевания, но носитель способен заразить окружающих.

Диагностика заболевания затруднена и даёт большое количество ложноотрицательных результатов: более 67% на 4-й день инфекции, до 38% в момент появления симптомов, до 20% на 8-й день заболевания (максимальная концентрация вируса) [5].

Трудности диагностики связаны с рядом специфических особенностей. Наиболее важная из них – процесс выделения РНК вируса из вирусных частиц.
 



Особенности отбора и исследования образцов биоматериала методом ПЦР на наличие COVID-19
Стадии отбора и анализа биологического материала – мазки верхних дыхательных путей (с комментариями и ссылками). Приведено краткое описание стадий с целью привлечения внимания читателя на критически важные моменты процесса лабораторной диагностики COVID-19.
 

  Название Описание Особенности
1 Забор мазка из верхних дыхательных путей ватной палочкой – SWAB Специальной палочкой с ватным тампоном на конце проводится соскоб с поверхности горла Данный вид биоматериала считается проблемным, в отличие от крови, или мокроты, поскольку отличается низкими показателями достоверности и воспроизводимости результата, однако, виду особенностей COVID-19 – единственный приемлемый способ диагностики заболевания
2 Транспортировка Биологический материал транспортируется в лабораторию В специальной транспортной среде – до 24 часов, в сухой пробирке – не более 4 часов после взятия образца
3 Предварительная подготовка образца в лаборатории Извлечение ватного тампона из пробирки или перенос жидкости в новую пробирку Ватный тампон необходимо аккуратно отжать, вращая по стенке пробирки и удалить из транспортной среды, или, в случае сухой транспортировки, поместить в физраствор, далее удалив его аналогичным образом
4 Выделение РНК вируса Могут использоваться наборы реагентов различных производителей Выход РНК зависит от качества используемого набора реагентов, от квалификации лаборанта, от времени выделения; полученный препарат РНК необходимо в течение 30 мин использовать на следующем этапе – то есть подготовить смесь и запустить реакцию
5 Подготовка реакционной смеси Готовится смесь РНК с необходимыми компонентами для проведения обратной транскрипции (или одновременно с ПЦР) Подготовка реакционной смеси – крайне нудная процедура, требующая высокой сосредоточенности лаборанта; в случае «ручной» обработки высока вероятность ошибки
6 ПЦР-реакция Происходит в амплификаторе без участия оператора Результат зависит от прибора


Приведены основные стадии процесса. Следует отметить, что наиболее важные стадии, от качества проведения которых зависит результат – 1 (забор биоматериала) и 3 (выделение РНК). Стадия 3 наиболее чувствительна к качеству использованных реагентов, а также исходному количеству биологического материала.

 

[1] Byambasuren O. et. al. Estimating the extent of true asymptomatic COVID-19 and its potential for community transmission: systematic review and meta-analysis. medRxiv. 2020
[2] Koh W.C. et al. What do we know about SARS-CoV-2 transmission? A systematic review and meta-analysis of the secondary attack rate, serial interval, and asymptomatic infection. medRxiv. 2020:2020.05.21.20108746
[3] Luo S-H. et al. A confirmed asymptomatic carrier of 2019 novel coronavirus (SARS-CoV-2). Chinese Medical Journal. 9000;Publish Ahead of Print; Hoehl S. et al. Evidence of SARSCoV-2 Infection in Returning Travelers from Wuhan, China. New England Journal of Medicine. 2020; Pan X. et al. Asymptomatic cases in a family cluster with SARS-CoV-2 infection. The Lancet Infectious Diseases. 2020
[4] Zou L. et al. SARS-CoV-2 Viral Load in Upper Respiratory Specimens of Infected Patients. New England Journal of Medicine. 2020
[5] Lauren M. Kucirka et. al. Variation in False-Negative Rate of Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction–Based SARS-CoV-2 Tests by Time Since Exposure. Annals of Interlal Medicine. 2020