Набор DNA Fragmentation Enzyme Mix разработан для простого и быстрого фрагментирования геномной ДНК (растворенная в буферах без ЭДТА или растворенная в ТЕ буфере). Фрагменты ДНК могут содержать 5’-фосфатные и 3’-гидроксильные группы.
Фрагментация ДНК ферментами очень проста и эффективна в сравнении с механическими методами фрагментирования. В ферментативной фрагментации имеется ряд преимуществ, среди которых быстрая и простая подготовка одновременно нескольких образцов и меньшие потери. Так же такая фрагментация не требует затрат на дорогостоящее оборудование.
Протокол DNA Fragmentation Enzyme Mix
Размеры фрагментов ДНК, полученных с помощью данного набора, обратно коррелируют со временем инкубации при 20°C в 1 шаге протокола. Фрагментированная ДНК подходит для протоколов подготовки NGS-библиотек. Наши ферменты для фрагментирования не создают смещений при секвенировании. Покрытие при секвенировании различно при использовании ферментативного метода фрагментации или механического.
Размеры фрагментов ДНК обратно коррелируют со временем инкубации. Данные, полученные с помощью Bioanalyzer, отображают время инкубации в 10 мин, 15 мин, 20 мин, 25 мин и соответсвующие им размеры фрагментов.
Характеристики:
- Быстрая ферментативная фрагментация: 30-45 мин
- Простой протокол: 3 мин ручной пробоподготовки
- ДНК может быть без ЭДТА или растворена в ТЕ буфере
- Совместимо с протоколами для NGS
Сравнение наборов ферментативного фрагметирования
|
|
DNA Fragmentation Enzyme Mix
|
DNA Fragmentation & Blunting Enzyme Mix
|
DNA Fragmentation & A-Tailing Enzyme Mix
|
|
Каталожный номер
|
40061
|
40063
|
40062
|
|
Длительность протокола
|
30-45 мин
|
30-45 мин
|
30-45 мин
|
|
Ручная пробоподготовка
|
3 мин
|
3 мин
|
3 мин
|
|
Совместимость с ДНК без ЭДТА
|
Да
|
Да
|
Да
|
|
Совместимость с ДНК в ТЕ буфере
|
Да
|
Да
|
Да
|
|
Одна реакция
|
Да
|
Да
|
Да
|
|
Концы фргментов ДНК
|
Случайные
|
Тупые
|
3' A-хвосты
|
|
Совместимость с протоколами NGS
|
NGS library prep
|
NGS library prep
PCR cloning
blunt end ligation
|
NGS library prep
PCR cloning
TA ligation
|
Комментарии ()