Набор DNA Fragmentation & A-tailing Enzyme Mix разработан для ферментативного фрагментирования геномной ДНК и добавления поли-А хвостов к 3’концам в одной реакции. 3’ ДНК с поли-А хвостами может быть использована для экспериментов в области молекулярной биологии таких, как NGS, молекулярное клонирование и т.д.
Протокол DNA Fragmentation & A-tailing Enzyme Mix
Смесь ферментов повышает эффективность последующих реакций. Размеры фрагментов ДНК, полученных с помощью данного набора, обратно коррелируют со временем инкубации при 20°C в 1 шаге протокола. Фрагментированная ДНК подходит для протоколов подготовки NGS-библиотек, клонирования ПЦР продуктов и TA-лигирования. Наши ферменты для фрагментирования не создают смещений при секвенировании в отличие от механического способа фрагментирования. Покрытие при секвенировании различно при использовании ферментативного метода фрагментации или механического.
Размеры фрагментов ДНК обратно коррелируют со временем инкубации. Данные, полученные с помощью Bioanalyzer, отображают время инкубации в 10 мин, 15 мин, 20 мин, 25 мин и соответсвующие им размеры фрагментов.
Характеристики:
- Быстрая ферментативная фрагментация: 30-45 мин
- Простой протокол: 3 мин ручной пробоподготовки
- ДНК может быть без ЭДТА или растворена в ТЕ буфере
- Повышает эффективность реакций при подготовке NGS-библиотек, TA-лигировании и т.д.
- Совместимо с протоколами для NGS
Сравнение наборов ферментативного фрагментирования
|
|
DNA Fragmentation Enzyme Mix
|
DNA Fragmentation & Blunting Enzyme Mix
|
DNA Fragmentation & A-Tailing Enzyme Mix
|
|
Каталожный номер
|
40061
|
40063
|
40062
|
|
Длительность протокола
|
30-45 мин
|
30-45 мин
|
30-45 мин
|
|
Ручная пробоподготовка
|
3 мин
|
3 мин
|
3 мин
|
|
Совместимость с ДНК без ЭДТА
|
Да
|
Да
|
Да
|
|
Совместимость с ДНК в ТЕ буфере
|
Да
|
Да
|
Да
|
|
Одна реакция
|
Да
|
Да
|
Да
|
|
Концы фрагментов ДНК
|
Случайные
|
Тупые
|
3' A-хвосты
|
|
Совместимость с протоколами NGS
|
NGS library prep
|
NGS library prep
PCR cloning
blunt end ligation
|
NGS library prep
PCR cloning
TA ligation
|
Комментарии ()