Набор реагентов GeneRead DNA FFPE Kit, QIAGEN

Набор реагентов GeneRead DNA FFPE Kit, QIAGEN

Парафиновые блоки – ткань, фиксированная сначала в формалине, затем – в парафине. Такой материал может долго храниться, но метод консервации приводит к сильной фрагментации ДНК/

Для увеличения выхода ДНК при работе с таким материалом в наборе предусмотрены дополнительные манипуляции:

  • удаление парафина (депарафинизирующий раствор),
  • восстановление формалиновых связей (нагревание в буфере FTB),
  • удаление остатков дезаминированного цитозина[1] (фермент урацил-N-гликозилаза).

Остальные стадии процесса: лизис, связывание на твёрдом носителе (силика на колонке), отмывка, элюирование – стандартные.

Набор по составу и работе напоминает другой набор QIAGEN – QIAamp DNA FFPE Tissue Kit (50) (56404). В новый набор добавлены реагенты, необходимые для полноценной работы с данным материалом.


[1] При фиксации цитозин дезаминируется до дезоксиурацила, что приводит к C-T-конверсии при секвенировании. При секвенировании данная модификация может интерпретироваться, как замена C>T, что приведёт к артефактным результатам.

 

×