Коммерциализация технологии пиросеквенирования

Высокоэффективное секвенирование (High-throughput sequencing) легло в основу методик пиросеквенирования и лицензирования технологии.

Молекулярно-генетические лаборатории разных уровней получили возможность:

  • определять de novo последовательность до 180 пар оснований;
  • ресеквенировать участки генома любого объекта;
  • анализировать частоты аллельной встречаемости;
  • идентифицировать однонуклеотидные вставки и делеции;
  • проводить количественный анализ метилирования ДНК и SNP типирование;
  • подтверждать, сравнивать и проверять результаты полногеномного анализа.

Информацию такого высокого уровня позволяют получать генетические анализаторы, выпуск которых освоен производителями оборудования для научных исследований и коммерческих лабораторий.

Критерии выбора платформы для геномных исследований

При выборе платформы для дорогостоящих исследований лаборатории ориентируются на важные критерии. Для генетических анализаторов это:

 

  • надежность в работе и доступность сервисного обслуживания;
  • валидность результатов исследования (уровень ошибок для одиночного чтения);
  • производительность (скорость одного чтения, продолжительность запуска);
  • автоматическая пробоподготовка;
  • стоимость чтения (цена расходных материалов);
  • качество программного обеспечения для интерпретации полученных данных.

 

Все это напрямую влияет на результаты работы научной лаборатории и рентабельность коммерческих проектов. 

 

 

Производители

 

В настоящее время на рынке анализаторов для генетических исследований существуют предложения от разных производителей. Они предлагают платформы 2-3 поколений, различающиеся по показателям производительности, принципам работы и цене расходных материалов.

Наиболее известны торговые марки:

• Thermo FS (IonTorrent, GeneStudio);
• Illumina (HiSeq, MiniSeq MiSeq, NextSeq);
• Roche (Junior, GS, FLX);
• Qiagen (PyroMark).

Качественная платформа включает собственно генетический анализатор, станцию вакуумной пробоподготовки, программное обеспечение, реагенты и наборы референтных образцов.

 

×